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本帖最后由 青菜567 于 2023-9-28 10:41 编辑
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无论就医看病还是体检,做的检查除了仪器检查如B超、CT、核磁共振、胃肠镜外,最多的就是生化检查,如基于血液、尿液、大便、痰液等的检测,因为这些体液中含有众多生物标志物,能够提供关于健康状况和疾病风险的重要信息。* k3 V3 W* j3 Y W
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以血液为例,血液是流动在人的血管和心脏中的一种红色不透明的粘稠液体,负责各类营养物质的输送以及机体产生的废物的排除。血液由血浆和血细胞组成。血浆中含有水、蛋白质和其他溶解物质,血细胞包括红细胞、白细胞和血小板。
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血液中一些指标的异常时常预示着身体某个器官或组织机能受损。目前基于血液的肿瘤早筛技术中经常提到的cfDNA就是血浆中存在的一种分子标志物。
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(参考于网络图片). i+ J8 E" `9 i+ X* G9 z; @3 X5 M) B
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如何理解cfDNA和ctDNA? - Z$ W- {: M4 `8 e0 B! `5 f
cfDNA全称为cell free DNA即细胞游离DNA,顾名思义就是指游离于细胞外的DNA。那么问题来了,DNA不都是在细胞内吗,怎么会跑到细胞外呢? 6 {0 f# j5 f! w' y! h5 i- k8 N: [; L
人体内的细胞不断更新换代,也就是说每天每时每刻我们体内都不断地有细胞在凋亡,又有新的细胞在形成。在细胞凋亡过程中有些DNA会“破壳而出”进入血液中,另外,人体在外界物理或化学刺激下引发的细胞坏死也会导致DNA释放到血液中,所以我们人体血液中都含有cfDNA。 4 n( e/ Q' u, ]( _: g `& Y8 q
(参考于网络图片)
4 U8 z" t. O( |# C% I& q3 ^但对于肿瘤患者来说,其血液中除了含有正常细胞凋亡或坏死释放的DNA外,还包括肿瘤细胞释放的DNA,这部分DNA有个专有名称叫ctDNA,全称为circulating tumor DNA即循环肿瘤DNA。因此对于肿瘤患者来说,血液中的cfDNA包含了ctDNA。 3 G8 B( h3 l, e, C0 ^; i
ctDNA主要来源于坏死的肿瘤细胞、凋亡的肿瘤细胞、循环肿瘤细胞(CTC)、肿瘤细胞分泌的外排体,其携带与肿瘤发生相关的分子信号,这些分子信号如同肿瘤的“身份指纹”,对肿瘤早筛、肿瘤精准治疗都具有非常重要的意义。
% K5 }+ w! s. L8 x# J/ }cfDNA全基因组测序肿瘤早筛技术 & A$ X! o1 l6 v2 A! `# f; l' \
通过上面我们了解了cfDNA和ctDNA的概念和区别,那么对于肿瘤早筛来说,到底检测的是cfDNA上的哪些信息?也就是哪些信息是与肿瘤的早期发生相关呢?这个需要经过临床研究进行标志物的筛选和验证。 " I. Z. e% [8 b( e3 s# y U0 T
和瑞基因研发团队通过临床研究发现,仅需受检者10ml静脉血,通过全基因组测序技术(WGS, Whole Genome Sequencing)和自主研发的机器学习算法,在全基因组范围内分析四个维度的特征提取及模型构建,包括末端序列、片段大小分布、核小体印迹、拷贝数变异,可精准评估六大高发高危癌种风险,包括肺癌及五大消化系统癌种(食管癌、胃癌、肝癌、胰腺癌、结直肠癌),并可准确溯源癌症风险器官。 & P' R# h) S5 \
那么如何理解四个维度呢?
5 R$ _: L8 q* T8 D4 _ H! a片段大小) l o' J, K+ n }# j
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DNA片段大小以核苷酸碱基对的数量表示,以bp为单位。肿瘤细胞释放的ctDNA片段大小比正常细胞释放的cfDNA更短。
# m4 i4 \1 d: f2 b) `, A: k 末端序列5 j9 Q; F3 I7 |5 B
在DNA片段化进入血液过程中,DNA发生了非随机断裂,其末端的几个核苷酸,癌与非癌具有不同偏好的末端切割模式。6 A# O& d! z- B9 A4 T1 a! R
! a$ C; z: ~# v- @2 Z 核小体印迹9 J- k2 |+ z8 W$ e- L* `, r
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肿瘤发生和发展的内因是原癌基因的活化和/或抑癌基因的失活等异常表达,而核小体印迹的松散程度可代表基因表达活跃程度的高低。
% z& \- q0 `9 H4 I/ a9 x. P 拷贝数变异
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3 n8 u0 A4 N1 s; \" Q( ?肿瘤组织通常存在拷贝数变异等染色体异常现象,而正常组织基本无此现象。 1 |" q/ n: U w$ }! H
(可点击图片放大查看) * }6 _; w, b6 F& A/ B, j
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